MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017167	CGC	2	6	30319	30324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133813
502	NC_017167	TCG	2	6	30370	30375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133813
503	NC_017167	CGA	2	6	30377	30382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133813
504	NC_017167	GTT	2	6	30383	30388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133813
505	NC_017167	TCC	2	6	30420	30425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133813
506	NC_017167	GAT	2	6	30455	30460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133813
507	NC_017167	GCC	2	6	30508	30513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133813
508	NC_017167	TCT	2	6	30517	30522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133813
509	NC_017167	GCA	2	6	30523	30528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133813
510	NC_017167	TTC	2	6	30530	30535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133813
511	NC_017167	TCCG	2	8	30577	30584	0 %	25 %	25 %	50 %	384133813
512	NC_017167	CCT	2	6	30633	30638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133813
513	NC_017167	CGC	2	6	30697	30702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133813
514	NC_017167	ACG	2	6	30729	30734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133813
515	NC_017167	TGC	2	6	30769	30774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133813
516	NC_017167	CGA	2	6	30814	30819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133813
517	NC_017167	CAGA	2	8	30874	30881	50 %	0 %	25 %	25 %	384133813
518	NC_017167	GCA	2	6	30964	30969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133813
519	NC_017167	TCC	2	6	31011	31016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133813
520	NC_017167	GGC	2	6	31040	31045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133813
521	NC_017167	CTT	2	6	31078	31083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133813
522	NC_017167	CGC	2	6	31098	31103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133813
523	NC_017167	CCA	2	6	31147	31152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133813
524	NC_017167	CGC	2	6	31204	31209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133813
525	NC_017167	GAT	2	6	31394	31399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133814
526	NC_017167	GCG	2	6	31420	31425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133814
527	NC_017167	GCC	2	6	31493	31498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133814
528	NC_017167	GCC	2	6	31523	31528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133814
529	NC_017167	GTG	2	6	31545	31550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133814
530	NC_017167	CGA	2	6	31568	31573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133814
531	NC_017167	CGG	2	6	31630	31635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133814
532	NC_017167	GGAC	2	8	31685	31692	25 %	0 %	50 %	25 %	384133814
533	NC_017167	GCG	2	6	31744	31749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133814
534	NC_017167	CG	3	6	31761	31766	0 %	0 %	50 %	50 %	384133814
535	NC_017167	GC	3	6	31798	31803	0 %	0 %	50 %	50 %	384133814
536	NC_017167	TGA	2	6	31804	31809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133814
537	NC_017167	GCG	2	6	31848	31853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133814
538	NC_017167	GC	3	6	31878	31883	0 %	0 %	50 %	50 %	384133814
539	NC_017167	TGC	2	6	31914	31919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133814
540	NC_017167	GCG	2	6	31940	31945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133814
541	NC_017167	GGA	2	6	32015	32020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133814
542	NC_017167	CCG	2	6	32030	32035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133814
543	NC_017167	CGT	2	6	32093	32098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133814
544	NC_017167	CA	3	6	32100	32105	50 %	0 %	0 %	50 %	384133814
545	NC_017167	ACGAG	2	10	32131	32140	40 %	0 %	40 %	20 %	384133814
546	NC_017167	GTC	2	6	32151	32156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133814
547	NC_017167	GC	3	6	32159	32164	0 %	0 %	50 %	50 %	384133814
548	NC_017167	TCGG	2	8	32173	32180	0 %	25 %	50 %	25 %	384133814
549	NC_017167	GGCG	2	8	32204	32211	0 %	0 %	75 %	25 %	384133814
550	NC_017167	GCC	2	6	32260	32265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133814
551	NC_017167	GGGA	2	8	32274	32281	25 %	0 %	75 %	0 %	384133814
552	NC_017167	GC	3	6	32537	32542	0 %	0 %	50 %	50 %	384133815
553	NC_017167	GCTCCA	2	12	32609	32620	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384133815
554	NC_017167	CGC	2	6	32621	32626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133815
555	NC_017167	ACC	2	6	32677	32682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133815
556	NC_017167	CGT	2	6	32700	32705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133815
557	NC_017167	CGC	2	6	32711	32716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133815
558	NC_017167	AGC	2	6	32743	32748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133815
559	NC_017167	CTG	2	6	32919	32924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133815
560	NC_017167	GAC	2	6	32968	32973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133815
561	NC_017167	CGT	2	6	32985	32990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133815
562	NC_017167	ATC	2	6	33055	33060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133815
563	NC_017167	CGG	2	6	33092	33097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133815
564	NC_017167	GAC	2	6	33339	33344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133816
565	NC_017167	CCG	2	6	33367	33372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133816
566	NC_017167	CGT	2	6	33379	33384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133816
567	NC_017167	GGCG	2	8	33391	33398	0 %	0 %	75 %	25 %	384133816
568	NC_017167	TGC	2	6	33402	33407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133816
569	NC_017167	CGG	2	6	33417	33422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133816
570	NC_017167	CGG	2	6	33509	33514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133816
571	NC_017167	ACG	2	6	33516	33521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133816
572	NC_017167	CGG	2	6	33537	33542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133816
573	NC_017167	CGG	2	6	33550	33555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133816
574	NC_017167	CTTCGC	2	12	33556	33567	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384133816
575	NC_017167	CGGC	2	8	33588	33595	0 %	0 %	50 %	50 %	384133816
576	NC_017167	GAG	2	6	33659	33664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133816
577	NC_017167	CGTCG	2	10	33665	33674	0 %	20 %	40 %	40 %	384133816
578	NC_017167	GAGT	2	8	33688	33695	25 %	25 %	50 %	0 %	384133816
579	NC_017167	CGCGG	2	10	33700	33709	0 %	0 %	60 %	40 %	384133816
580	NC_017167	GTG	2	6	33767	33772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133816
581	NC_017167	ATG	2	6	33773	33778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133816
582	NC_017167	G	6	6	33823	33828	0 %	0 %	100 %	0 %	384133816
583	NC_017167	GCA	2	6	33844	33849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133816
584	NC_017167	CCG	2	6	33877	33882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133816
585	NC_017167	CCA	2	6	33903	33908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133816
586	NC_017167	AGA	2	6	33910	33915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133816
587	NC_017167	CTT	2	6	33928	33933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133816
588	NC_017167	GCGGGC	2	12	33948	33959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133816
589	NC_017167	GC	3	6	34006	34011	0 %	0 %	50 %	50 %	384133816
590	NC_017167	CGC	2	6	34025	34030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133816
591	NC_017167	GAGG	2	8	34109	34116	25 %	0 %	75 %	0 %	384133816
592	NC_017167	TGG	2	6	34131	34136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133816
593	NC_017167	GTCC	2	8	34148	34155	0 %	25 %	25 %	50 %	384133816
594	NC_017167	GGT	2	6	34241	34246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133816
595	NC_017167	CAC	2	6	34313	34318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133816
596	NC_017167	GCGCC	2	10	34391	34400	0 %	0 %	40 %	60 %	384133816
597	NC_017167	GGA	2	6	34403	34408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133816
598	NC_017167	GCG	2	6	34414	34419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133816
599	NC_017167	CGA	2	6	34438	34443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133816
600	NC_017167	GC	3	6	34457	34462	0 %	0 %	50 %	50 %	384133816
601	NC_017167	TCC	2	6	34506	34511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133816
602	NC_017167	TCG	2	6	34518	34523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133816
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605	NC_017167	CGG	2	6	34719	34724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133817
606	NC_017167	CGC	2	6	34767	34772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133817
607	NC_017167	CCT	2	6	34788	34793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133817
608	NC_017167	GGC	2	6	34809	34814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133817
609	NC_017167	CAA	2	6	34825	34830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133817
610	NC_017167	GAG	2	6	34855	34860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133817
611	NC_017167	CGC	2	6	34885	34890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133817
612	NC_017167	CCA	2	6	34923	34928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133817
613	NC_017167	CGC	2	6	34945	34950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133817
614	NC_017167	CG	3	6	35094	35099	0 %	0 %	50 %	50 %	384133817
615	NC_017167	CGT	2	6	35133	35138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133817
616	NC_017167	GGCG	2	8	35145	35152	0 %	0 %	75 %	25 %	384133817
617	NC_017167	GCG	2	6	35160	35165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133817
618	NC_017167	CTC	2	6	35209	35214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133817
619	NC_017167	TACGCG	2	12	35237	35248	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384133817
620	NC_017167	GCC	2	6	35263	35268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133817
621	NC_017167	GTTCG	2	10	35278	35287	0 %	40 %	40 %	20 %	384133817
622	NC_017167	CG	3	6	35298	35303	0 %	0 %	50 %	50 %	384133817
623	NC_017167	ACT	2	6	35360	35365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133817
624	NC_017167	CCGT	2	8	35462	35469	0 %	25 %	25 %	50 %	384133817
625	NC_017167	GGCG	2	8	35472	35479	0 %	0 %	75 %	25 %	384133817
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627	NC_017167	CCCGG	2	10	35604	35613	0 %	0 %	40 %	60 %	384133817
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